DSM–18020菌株expI基因的克隆及生物信息学分析
DOI:
作者:
作者单位:

作者简介:

通讯作者:

中图分类号:

基金项目:

中国农业科学院科技创新工程项目(CAAS–ASTIP–2015–IBFC09);湖南省自然科学基金项目(2017JJ3351);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610242016025)


Author:
Affiliation:

Fund Project:

  • 摘要
  • |
  • 图/表
  • |
  • 访问统计
  • |
  • 参考文献
  • |
  • 相似文献
  • |
  • 引证文献
  • |
  • 资源附件
  • |
  • 文章评论
    摘要:

    为克隆和研究软腐病菌Dickeya dadantii的信号分子合成酶基因expI,从 Dickeya属模式菌 DSM–18020的基因组中扩增获得了基因expI。生物信息学分析显示,该基因全长639 bp,与Dickeya dadantii 3937的N–酰基高丝氨酸内酯( N–acyl–homoserine lactone,AHLs)合成酶基因同源性达99%;DSM–18020 expI编码的蛋白质相对分子质量为24 704,理论等电点为5.85,整个肽链中均匀分布疏水氨基酸,且比亲水性氨基酸多,没有信号肽存在;将获得的expI基因构建到表达载体 pET–28α(+)并转入大肠杆菌 BL21( DE3),诱导后的表达产物与理论值一致。

    Abstract:

    In order to study the signal molecule synthase gene expI of Dickeya dadantii, the gene expI was amplified from the genome of the type strain DSM–18020. Bioinformatics analysis showed that there was a complete open reading frame (ORF) in DSM–18020 expI, which was 639 bp in length and had 99% homology to N–acyl–homoserine lactone (AHLs) synthetase of D. dadantii 3937. The molecular weight of the protein encoded by DSM–18020 expI is 24,704, and the theoretical isoelectric point is 5.85. The hydrophobic amino acids are more abundant than hydrophilic amino acids and distributed evenly throughout the peptide chain, with no signal peptide. expI gene was cloned into the expression vector pET28α and transformed into Escherichia coli BL21 (DE3). The expression product was basically identical with the expectation.

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

程毅,周静煌,严准,高春生,李智敏,余永廷. DSM–18020菌株expI基因的克隆及生物信息学分析[J].湖南农业大学学报:自然科学版,2018,44(1):.

复制
分享
文章指标
  • 点击次数:
  • 下载次数:
  • HTML阅读次数:
  • 引用次数:
历史
  • 收稿日期:
  • 最后修改日期:
  • 录用日期:
  • 在线发布日期: 2018-01-30
  • 出版日期: