烟草WS38生长素结合蛋白基因cDNA的克隆及序列分析
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Cloning and Sequence Analysis of Auxin-binding Proteins Gene cDNA of Nicotiana tabacum WS38
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    摘要:

    以烟草Nicotiana tabacum WS38为材料,根据GenBank中登录的烟草生长素结合蛋白(ABP1)氨基酸序列设计引物,通过RT- PCR克隆了烟草WS38ABP1基因cDNA分子编码区,序列全长为564 bp,可编码一188氨基酸的多肽。利用DNAMAN软件对该序列翻译获得的多肽序列与报导的烟草生长素结合蛋白氨基酸序列比较,两者同源性为98.4%,存在着3个氨基酸的差异,但差异氨基酸对ABP1结构和功能影响微弱。可以认为克隆的cDNA序列即为烟草WS38 ABP1 cDNA,不同品种烟草ABP1基因存在的核苷酸单位点多态性(SNP)造成了两者氨基酸序列的差异。

    Abstract:

    We have cloned Nicotiana tabacum WS38 ABP1 cDNA coding sequence by RT-PCR with the primers that ware designed according to reported Nicotiana tabacum ABP1 amino acid sequence in GenBank. Sequencing shows that the length of the cDNA is 564 bp. Information analysis indicated that the open reading frame can encodes 188 amino acids polypeptide with the 98.4% homology with the reported ABP1. It demonstrated that the ABP1 in Nicotiana tabacum is varied in different cultivars and there are some single nucleic acid polymorphasim with WS38 and T85.

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刘晓柱.烟草WS38生长素结合蛋白基因cDNA的克隆及序列分析[J].湖南农业大学学报:自然科学版,2010,36(4):388-391.

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  • 收稿日期:2010-04-14
  • 最后修改日期:2010-04-14
  • 录用日期:2010-07-16
  • 在线发布日期: 2010-08-13
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